Salah satu struktur kunci di otak yang telah ditemukan berubah secara fisik melalui meditasi jangka panjang adalah thalamus.
Talamus adalah struktur berbentuk kenari yang berada jauh di tengah otak. Ini adalah stasiun pemancar untuk semua informasi sensorik yang mengalir ke seluruh otak. Jadi, apakah informasi itu masuk melalui saraf optik kita, telinga kita, melalui sensasi sentuhan, melalui bau, atau melalui rasa, setiap bit data bergerak melalui thalamus.
Dalam tradisi yoga, area pusat di otak yang ditempati thalamus memainkan peran penting dalam kebangkitan spiritual. Ketika bundel saraf yang sangat besar keluar dari tulang belakang dan masuk ke batang otak, mereka melakukan perjalanan pertama melalui thalamus sebelum didistribusikan melalui corpus callosum sebagai banyak sekali serat saraf yang bercabang di seluruh neokorteks, di sepanjang mahkota kepala. Ini multi-cabang jutaan neuron sebagian terdiri dari korelasi fisik chakra sahasrara atau "mahkota", pusat energi halus juga disebut sebagai lotus dengan ribuan petal dalam filosofi yoga.
Dekat dengan area pusat ini, di mana ikatan serabut saraf bertemu di thalamus, adalah kelenjar hipofisis, hipotalamus, kelenjar pineal, dan ventrikel ketiga, juga dikenal sebagai Gua Brahma di Kriya Yoga. Satu atau lebih area sentral ini telah menjadi fokus batin meditasi dalam berbagai tradisi meditasi selama ribuan tahun. Area sentral ini sering dikaitkan dengan wawasan mendalam, visi spiritual, dan persepsi yang lebih tinggi. Dengan demikian, itu telah disebut sebagai "mata ketiga," memainkan peran yang sama-sama sentral dalam membangkitkan sistem bio-listrik tubuh, termasuk kundalini-shakti laten di pusat akar serta kesadaran tanpa syarat, melelehkan hati. cinta di pusat jantung.